大腸直腸癌是目前國內癌症死亡率排名第三位，每年有超過四千人死於大腸直腸癌。大腸癌治癒的機會相當高，第一期患者治癒率高達90%，早期診斷相當重要。多數大腸癌的發生經過良性大腸瘜肉階段，經多年演變成惡性。而大腸鏡檢查不但是檢查大腸直腸癌最好的方法，且大腸瘜肉可經由大腸鏡檢查切除治療，預防癌症產生。大腸鏡檢查主要適應症包含下列幾項：
- 血便或糞便潛血檢查陽性
- 不明原因貧血
- 排便習慣改變
- 下腹疼痛，懷疑大腸病灶，但無腹膜炎徵兆
- 潰瘍性大腸炎或克隆氏症病史定期檢查
- 大腸息肉切除後病史定期檢查
- 大腸癌病史定期檢查
- 其它懷疑大腸癌徵兆如體重減輕，CEA高等
大腸鏡檢查對大多數人來說是一項難以接受的檢查，主要就是檢查時的疼痛令人卻步。如果只是診斷性大腸檢查，有其他較舒適且準確率相當的檢查如大腸鋇劑攝影、電腦斷層虛擬大腸鏡等，但這些檢查無法執行治療性步驟如瘜肉切除。大腸鏡檢查造成腹痛的原因主要是過度牽扯腸壁及腸系膜，其次是大腸因灌注氣體造成腸道壓力引起，另外受檢者對疼痛的敏感度也是決定疼痛程度的重要因素。雖然有許多技術上的方法和使用二氧化碳充氣、灌注熱水、使用較細軟大腸鏡等方式可以減輕檢查時的疼痛，但都無法像給予受檢者鎮靜或麻醉來的有效。雖然有部分學者認為無痛大腸鏡增加一個麻醉部分，造成許多問題，包含必須有心肺功能監視器、多出麻醉人力及費用、增加麻醉恢復時間、及麻醉的風險，同時也可能提高大腸鏡檢查併發症的機率，而比較傾向不在患者接受麻醉下執行大腸鏡。但無痛大腸鏡可避免檢查時的疼痛感，比較人性化，雖可能有上述問題，但能為多數人接受，在國外已行之有年，幾乎是大腸鏡的標準作法。
一般大腸鏡檢查可事先給予受檢者減緩腸蠕動藥物及注射止痛藥，但效果不佳。現在多數醫院的無痛大腸鏡為求給予受檢者最安全舒適檢查狀況，都是由麻醉醫師在完善心肺功能監視下親自執行麻醉。給予的藥物有多種選擇，如Midazolam、Propofol等，主要是注射短效鎮靜藥物讓受檢者達到感受不到疼痛，但稍有意識的”清醒鎮靜”情況下接受大腸鏡檢查，檢查完成後受檢者可在短時間內清醒。
雖然無痛大腸鏡比起傳統大腸鏡多了一個麻醉風險，也可能有較高併發症的機率。但鎮靜或麻醉確實可讓較多患者能接受大腸鏡檢查，且重複受檢意願也較高。審慎評估合適患者且在有經驗操作者執行下，避免併發症產生，無痛大腸鏡可提供必須接受大腸鏡檢查者一個較舒適的選擇。