本部前身病理部由台北榮總病理部前主任劉宏璋教授及相關同仁規劃設計。
民國七十九年十月三十一日本院（北榮高雄分院）開幕，病理部曾暉華主任亦於是日率同仁展開各項病理診斷作業。
民國八十一年十月三十一日本院獨立為高雄榮民總醫院。
民國八十六年八月十六日病理部及醫學檢驗部合併為病理檢驗部。
民國 九十五年六月由王志生教授擔任第二任部長，帶領實驗室通過TAF認證並成立分子病理科。
民國 一百零三年八月十六日由院部禮聘李恒昇教授擔任第三任部長，導入各項以病人為中心的改革創新服務思維。