本院業務成本依成本能否由各部門主管控制之程度，分為可控、部份可控、完全不可控三類：
一、可控成本：係指某項成本的發生或分攤，部門主管於權責範圍內有權核准，例如用人費用、服務費用、材料及用品費、折舊、折耗及攤銷等直接費用及調度室、會議中心、勤務中心、內視鏡中心、心導管室使用費等可控分攤成本。
二、部份可控成本：係指某項成本的分攤，與部門攸關性較高且採取客觀數據如氣體出口、話機數、服務量等作為分攤基礎，故部份程度內可由部門主管加以控制者，例如醫療氣體、總機房、資訊處理、網路設施、洗衣工場等分攤公用成本、供應中心、門診護理站、手術室、恢復室、病房等分攤護理支援成本及掛號、病歷、住院組等分攤行政管理成本。
三、完全不可控成本：係指某項成本的分攤，完全無法由部門主管加以控制者，例如電及空調、水、消毒清潔、垃圾處理等公用成本及行政管理成本等。