衛生福利部高屏區緊急醫療應變中心之責任區域橫跨高雄市、屏東縣、澎湖縣等三縣市，藉由有效的統籌高屏地區現有的緊急醫療救護資源，將各責任醫院與急救責任醫院納入應變醫療計畫，指揮中心將依事件指揮系統（Incident Command System, ICS）架構設置，於指揮中心編制執行長及24小時輪值人員，建立各種緊急應變流程、提供相關教育訓練，監測各種危機狀況，隨時對資料進行蒐集、分析，以掌握最新的資訊，提供決策參考，利用協調聯絡功能，以利決策命令有效傳達。