• 肺部疾病,如: 肺癌,氣胸,膿胸,支氣管擴張,肺氣腫 ◦肺癌
本科實行肺癌手術之經驗豐富,每年均達二百餘例,為南部施行肺癌手術最多之醫院 . 自術前診斷, 手術治療, 以最新的抗癌藥物進行化學治療（Gemcitabine, Vinorelbine, Taxol, Taxotere,Iressa, Tarceva,Alimta...)及轉介至放射腫瘤科進行放射腺治療, 至術後追蹤檢查,均有一系列完整之服務.
詳細資料請參考:肺癌手術方式及預後
◦ 氣胸
手術治療, 是最有效降低氣胸再發的治療方法。因為原發性自發性氣胸經觀察及胸管引流等保守治療後，復發的機率很高，平均可達約四分之一以上，尤其是復發作患者，更有超過一半以上的復發機會。
本科利用新式微創胸腔內視鏡手術治療氣胸，使氣胸手術的風險及住院天數縮短，傷口減小，為氣胸治療更佳的選擇。
詳細資料請參考:醫療資訊:淺談氣胸
◦肺氣腫
肺氣腫病患的治療,可利用最新的肺容積減量(Lung Volume Reduction)手術,來減輕肺氣腫的臨床症狀. •食道疾病,如: 吞食困難,酸水逆流或胸痛,食道癌
•胃賁門癌
• 胸壁異常,如:漏斗胸,雞胸
• 胸部外傷
• 重症肌無力,縱膈腔腫瘤 ◦重症肌無力
重症肌無力在本科的治療方式是 :以外科胸腺切除術切除胸腺,再以臨床藥物控制,可使重症肌無力的症狀得到緩解.
詳細資料請參考:重症肌無力之外科治療
• 肺臟移植手術 ◦應症範圍包括: 肺氣腫,肺纖維化,肺高壓,肺臟支氣管擴張,..等嚴重影響心肺功能的疾病,經內科治療無效,有呼吸衰竭之生命危險時,可施行肺臟移植手術.
◦ 如病人有前述之適應症,年齡低於限制年齡 (雙肺移植小於55歲,單肺移植小於60歲)皆可實行.
◦危險性及併發症: 缺血,肺臟缺血後再灌注引起之損傷,支氣管吻合處狹窄,移植肺臟被排斥, 移植肺臟功能衰竭,阻塞性小支氣管炎.